Table 3 Consistency analysis between plasmids and resistant/virulent genes
From: Epidemiological and genomic characteristics of global blaNDM-carrying Escherichia coli
Genes | IncFII (n = 1163) | IncFIB (n = 1157) | IncX3 (n = 888) | IncFIA (n = 756) | Col (n = 440) | IncY (n = 338) | IncI1-I (n = 321) | P0111 (n = 306) | IncHI2 (n = 287) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
sul1 (n = 1234) | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.010 | 0.000 | 0.000 |
mph(A) (n = 1173) | 0.747* | 0.588* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
blaTEM-1b (n = 1092) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
tet(A) (n = 1084) | 0.008 | 0.012 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
aph(6)-Id (n = 913) | 0.000 | 0.000 | 0.428* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
aadA2 (n = 906) | 0.000 | 0.000 | 0.586* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
aph(3’’)-Ib (n = 898) | 0.000 | 0.000 | 0.767* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
dfrA12 (n = 826) | 0.000 | 0.000 | 0.053* | 0.016 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
floR (n = 826) | 0.000 | 0.000 | 0.032 | 0.028 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
blaOXA-1 (n = 459) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.475* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
terC (n = 1766) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
Gad (n = 1480) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
traT (n = 1205) | 0.093* | 0.086* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
iss (n = 910) | 0.000 | 0.000 | 0.464* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
sitA (n = 756) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
hra (n = 689) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.020 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
lpfA (n = 631) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
fyuA (n = 561) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
irp2 (n = 560) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
ompT (n = 530) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
iucC (n = 456) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.565* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
capU (n = 485) | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.105* | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |